增值稅發(fā)票逾期不能抵扣的完整處理辦法如下所示：

一、發(fā)票逾期抵扣，還有機(jī)會，國家稅務(wù)總局公告2011年第50號《關(guān)于逾期增值稅扣稅憑證抵扣問題的公告》規(guī)定：

一、對增值稅一般納稅人發(fā)生真實(shí)交易但由于客觀原因造成增值稅扣稅憑證逾期的，經(jīng)主管稅務(wù)機(jī)關(guān)審核、逐級上報，由國家稅務(wù)總局認(rèn)證、稽核比對后，對比對相符的增值稅扣稅憑證，允許納稅人繼續(xù)抵扣其進(jìn)項(xiàng)稅額。（提醒注意：權(quán)限是國家稅務(wù)總局）增值稅一般納稅人由于除本公告第二條規(guī)定以外的其他原因造成增值稅扣稅憑證逾期的，仍應(yīng)按照增值稅扣稅憑證抵扣 期限有關(guān)規(guī)定執(zhí)行。

二、客觀原因包括如下類型：

（一）因自然災(zāi)害、社會突發(fā)事件等不可抗力因素造成增值稅扣稅憑證逾期；

（二）增值稅扣稅憑證被盜、搶，或者因郵寄丟失、誤遞導(dǎo)致逾期；

（三）有關(guān)司法、行政機(jī)關(guān)在辦理業(yè) 務(wù)或者檢查中，扣押增值稅扣稅憑證，納稅人不能正常履行申報義務(wù)，或者稅務(wù)機(jī)關(guān)信息系統(tǒng)、網(wǎng)絡(luò)故障，未能及時處理納稅人網(wǎng)上認(rèn)證數(shù)據(jù)等導(dǎo)致增值稅扣稅憑證逾期；

（四）買賣雙方因經(jīng)濟(jì)糾紛，未能及時傳遞增值稅扣稅憑證，或者納稅人變更納稅地點(diǎn)，注銷舊戶和重新辦理稅務(wù)登記的時間過長，導(dǎo)致增值稅扣稅憑證逾期；

（五）由于企業(yè)辦稅人員傷亡、突發(fā)危重疾病或者擅自離職，未能辦理交接手續(xù)，導(dǎo)致增值稅扣稅憑證逾期；（大白菜 提醒：這一條是企業(yè)的救命稻草）

（六）國家稅務(wù)總局規(guī)定的其他情形。

三、增值稅一般納稅人因客觀原因造成增值稅扣稅憑證逾期的，可按照本公告附件《逾期增值稅扣稅憑證抵扣管理辦法的規(guī)定，申請辦理逾期抵扣手續(xù)。

評論：這是國家稅務(wù)總局非常人性化的一個規(guī)定，雖然程序在實(shí)際運(yùn)作時相當(dāng)麻煩，但總算給納稅人了一個改正的機(jī)會！

二、收到國家稅務(wù)總局的批復(fù)以后，如何操作呢？

首先我們在納稅申報表的表二《進(jìn)項(xiàng)稅明細(xì)》里錄入批復(fù)允許抵扣的逾期進(jìn)項(xiàng)稅，其中的35行就包括了逾期抵扣的2份發(fā)票和1份當(dāng)期的正常認(rèn)證發(fā)票

但是抄稅時會出現(xiàn)這樣的提示：提醒比對通不過！與遠(yuǎn)程認(rèn)證系統(tǒng)的數(shù)據(jù)不符！

怎么辦？ 處理方法：讓稅局從后臺， 辦理強(qiáng)行比對通過就可以 了！